线编辑软件Evolview制作进化树教程 Evolview使用方法介绍

作者: MM

今天分享的软件是Evolview——一款强大的进化树在线编辑软件。它可以制作出高颜值的进化树,并且提供17种示例树,以及5个具体项目示例。

它还可以导出多种格式的文件,包括pdf、svg、tiff、png,而且绘制完成的进化树可永久性的保存在网站里,也可进行共享。下面我们就来介绍一下Evolview的使用方法:

一、生成物种树

网址://www.evolgenius.info/evolview/#login注册账号,登录:操作栏共分四栏:基础、高级、注释与导出首先,把树上传上传之后,可以把树导出为svg的矢量格式可以选择物种树的表现形式:进化分支图(不带枝长),系统发生图(带枝长)、斜向进化分支图、圆形进化分支图、圆形系统发生图

(进化分支图)

(系统发生图)

(斜向进化分支图)(圆形进化分支图)(圆形系统发生图)更改枝的边角圆角斜角网页模式,字体变小 显示支持率、支持率斜体与字体大小 显示枝长、枝长斜体与字体大小 显示物种名方式 放大缩小选项 图像占屏幕比例 扩展与压缩图像 物种名字体 枝的粗细 调整角度 开始注释 由于图片数量限制,更全图标解读含义可在公号科研日精进内查看。

示例树和具体项目

此外,网站还提供了17种类型的示例树,以及5个具体项目示例。

1. yeast duplications(饼图)Duplication(两种颜色)overlap with WGD(两种颜色)overlap with other duplicates(四种颜色)pie with strokes(加圆圈)pie with data values shown(显示具体值)

2. ensembl compara 2011(分枝颜色)Branch Colors(分枝颜色)

Mouse(物种名内圈颜色)back ground(物种名内圈颜色)Charts(物种名外圈颜色)3. a demo of datasets(叶片颜色)branch colors(分枝颜色)leaf colors(叶片颜色)leaf background colors(叶片背景色)bars(条形图)color strips(多边形)

4. bars(条形图)bars1(条形图1)bars2 with data shown(条形图2显示数据)5. leaf decoration and stroke(叶片装饰)leaf deco and stroke(叶片装饰1)

leaf deco and stroke(叶片装饰2)6. protein domain(蛋白结构域)7.分组标签1、2branch color to root(到树根的颜色)leaf colors(叶片颜色)style 5(树枝分组)

style 2(叶片分组)

default style(附加分组)

8. group label style 3(分组风格3)

9. group label style 4(分组风格4)

10点状图with strokes(圆形带圈)rect without strokes(正方形不带圈)11.热图

12.列状图

13.bootstrap值bootstrap 1

bootstrap 2bootstrap 3bootstrap 4bootstrap 5

bootstrap 6

14.物种名

15.多bootstrap值

16.时间轴

17.网页模式leaf label green

leaf label pink

好了,以上就是使用使用Evolview对系统发育树进行美化操作。

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